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東直門醫(yī)院創(chuàng)辦于1958年，是國家“211工程”、“985工程優(yōu)勢學科創(chuàng)新平臺”、國家“雙一流”建設高校北京中醫(yī)藥大學第一臨床醫(yī)學院，是首批國家大型綜合性三級甲等中醫(yī)醫(yī)院和國家示范中醫(yī)醫(yī)院，是首批國家中醫(yī)臨床研究基地和國家藥物臨床試驗機構，是世界衛(wèi)生組織中醫(yī)適宜技術項目培訓基地和國家級中醫(yī)學實驗教學示范中心，是首批國家醫(yī)學中心（中醫(yī)輔導類）和國家中醫(yī)藥傳承創(chuàng)新中心。
面向新時代，醫(yī)院創(chuàng)造性構建了“兩區(qū)一部”戰(zhàn)略布局，東城院區(qū)位于海運倉5號，通州院區(qū)位于翠屏西路116號，國際部位于東四北大街279號，形成了集傳承人文傳統(tǒng)、傳導醫(yī)學前沿、傳播中華精粹于一體的蓬勃發(fā)展態(tài)勢。
醫(yī)院始終堅持“人才第一”理念，建設了一支以學術大師為引領、名醫(yī)名家為主體、中青年骨干為后繼的專家隊伍，成為中醫(yī)藥事業(yè)傳承創(chuàng)新發(fā)展的堅強力量。先后涌現(xiàn)出董建華、王永炎、田金洲3位中國工程院院士，創(chuàng)造了中醫(yī)系統(tǒng)腦病學科“一門三院士”的奇跡。醫(yī)院培養(yǎng)出國醫(yī)大師2人，全國名中醫(yī)3人，首都國醫(yī)名師20人，岐黃學者5人，青年岐黃學者2人，享受政府特殊津貼專家30人，“全國五一勞動獎章”獲得者1人，全國衛(wèi)生計生系統(tǒng)先進工作者1人。國家杰青1人，國家優(yōu)青1人，北京市杰青1人，入選“國家級百千萬人才工程”國家級人選1人，國家科技創(chuàng)新領軍人才1人，國家科技創(chuàng)新青年拔尖人才1人，教育部“新世紀優(yōu)秀人才支持計劃”6人，全國優(yōu)秀中醫(yī)臨床人才21人，“北京市科技新星”9人，首都名中醫(yī)9人，首都青年名中醫(yī)6人，優(yōu)秀名中醫(yī)1人，“首都十大健康衛(wèi)士”2人，“首都健康衛(wèi)士”4人，“白求恩式好醫(yī)生”1人。具有高級專業(yè)技術職稱者達458人。
作為三級甲等中醫(yī)醫(yī)院，始終堅持守正創(chuàng)新，致力于以中醫(yī)藥和中西醫(yī)結合手段解決重大疾病和現(xiàn)代難治病的防治問題，積極促進醫(yī)學發(fā)展進步。擁有教育部重點學科1個，國家中醫(yī)藥管理局重點學科9個，北京市重點學科2個。國家臨床重點�？�6個，區(qū)域中醫(yī)（�？疲┰\療中心5個，國家中醫(yī)藥管理局重點�？�16個，北京市重點�？�13個。目前設置臨床專業(yè)86個，編制床位1574張，職工總數(shù)2700余人；年門急診量超過300萬人次。腦病中心匯集腦病科、腦外科、腦病康復科、NICU、高壓氧艙科等功能單元，床位300余張；心血管中心匯聚心血管科、心外科、心臟康復科、CICU等，床位200余張；腎病內分泌中心包括腎病科、內分泌科、透析室等，床位近200張；骨傷中心擁有6個病區(qū)，床位200余張；呼吸中心具有呼吸科、胸外科、RICU、氣管鏡介入中心等，床位150余張。五大中心均實行內科、外科、中醫(yī)藥康復一體化診療模式，顯著提高醫(yī)院的綜合診治能力。脾胃病中心、血液腫瘤中心、中醫(yī)生殖中心（婦產科、男科）等亦以其鮮明特色和獨特優(yōu)勢為全國各地患者提供優(yōu)質服務。手術麻醉科、介入治療中心、放射醫(yī)學科、超聲醫(yī)學科、檢驗醫(yī)學科和病理科等作為醫(yī)院的醫(yī)技平臺和特色科室，配備有PETCT、MRI、CT、血管造影機、超聲診斷儀、全自動生化檢測儀、氬氦刀、光動力治療儀等多種高端醫(yī)療設備1200余臺件，總價值達到3億元。
作為大學臨床醫(yī)學院，醫(yī)院始終堅持立德樹人，一貫重視教育教學工作，形成了臨床教學的特色優(yōu)勢，是高素質中醫(yī)藥人才培養(yǎng)的重要基地。擁有全國名老中醫(yī)藥專家傳承工作室17個，北京中醫(yī)藥“薪火傳承3+3”工程“二室一站”18個，教育部創(chuàng)新團隊1個。一級學科學位授予點2個，涵蓋6個博士學位授權點、7個碩士學位授權點。博士研究生導師73人，碩士研究生導師110人。獲評國家級優(yōu)秀教學團隊1個、北京市優(yōu)秀教學團隊1個，國家中醫(yī)藥高等學校教學名師1人、北京市教學名師5人。醫(yī)院以雄厚的師資隊伍、優(yōu)異的教學業(yè)績和豐富的辦學經驗在業(yè)界享有盛譽，是國家級中醫(yī)類別執(zhí)業(yè)醫(yī)師資格考試實踐技能考試基地，北京市中醫(yī)系統(tǒng)唯一的國家級住院醫(yī)師規(guī)范化培訓重點專業(yè)基地，教育部大學生校外實踐教育基地。
作為國家中醫(yī)臨床研究基地，醫(yī)院始終堅持科技興院，圍繞國家戰(zhàn)略需求和中醫(yī)藥重大科學問題，聚焦創(chuàng)新驅動，在中醫(yī)臨床科研前沿創(chuàng)造了突出業(yè)績。擁有教育部中醫(yī)內科學重點實驗室1個，國家中醫(yī)藥管理局重點研究室3個，國家中醫(yī)管理局三級實驗室2個，北京市中醫(yī)內科學重點實驗室1個。獲國家科技進步獎二等獎2項。在中國醫(yī)院科技量值排名中，連續(xù)兩年位列全國中醫(yī)系統(tǒng)前三。醫(yī)院承擔的科研項目和經費持續(xù)增長，特別是國家自然科學基金課題數(shù)量與質量大幅提升，連續(xù)兩年位列北京中醫(yī)藥大學二級院所和北京地區(qū)中醫(yī)醫(yī)院之首。醫(yī)院注重平臺建設，以權威機構和優(yōu)勢平臺承載多項高層次研發(fā)項目，產出了臨床科研開發(fā)的豐碩成果，在研究型中醫(yī)院建設中邁出了堅實步伐。
作為公立醫(yī)療機構，醫(yī)院始終堅持把公益放在首位，以“大醫(yī)精誠”踐行初心使命，面向人民群眾奉獻大愛，將優(yōu)秀醫(yī)學論文書寫在祖國大地上。充分發(fā)揮三甲醫(yī)院重要作用，在全國率先搭建“醫(yī)聯(lián)體”平臺，組建輻射全國多個省份的中醫(yī)戰(zhàn)略聯(lián)盟，實施“全國鄉(xiāng)村中醫(yī)師3+3提升工程”、開創(chuàng)了培養(yǎng)農村中醫(yī)藥人才新模式。積極助力鄉(xiāng)村振興，落實援蒙、援疆及支援山西五寨、西藏班戈、甘肅定西等地的對口幫扶工作。在防控新冠肺炎疫情過程中，積極發(fā)揮中西醫(yī)結合診療優(yōu)勢，以實際行動踐行“敬佑生命、救死扶傷、甘于奉獻、大愛無疆”精神。榮獲“全國抗擊新冠肺炎疫情先進集體”“北京市抗擊新冠肺炎疫情先進集體”“全國衛(wèi)生健康系統(tǒng)新冠肺炎疫情防控工作先進集體”，獲評“全國抗擊新冠肺炎疫情先進個人”1人，“全國衛(wèi)生健康系統(tǒng)新冠肺炎疫情防控工作先進個人”1人，“北京市抗擊新冠肺炎疫情先進個人”6人，“北京市先進工作者”1人，“首都中醫(yī)榜樣”3人。東直門醫(yī)院援鄂醫(yī)療隊凱旋旗、防護服、職工請戰(zhàn)書等十余件抗疫物品被國家博物館永久收藏。
作為國家“雙一流”建設高校的附院，醫(yī)院始終堅持將全球視野作為辦醫(yī)的著眼點，立足首都、輻射全國、放眼世界，以服務人類健康為己任，形成跨越時空的東直門醫(yī)院大醫(yī)療圈。早在1991年即建立了德國魁茨汀醫(yī)院，成為歐洲最早納入醫(yī)療保險的正規(guī)中醫(yī)醫(yī)院，迄今仍是唯一享有國外醫(yī)保的中醫(yī)醫(yī)療機構，被譽為中醫(yī)藥走向世界的典范。由東直門醫(yī)院管理的美國中醫(yī)中心、澳大利亞中醫(yī)中心也是重要的中醫(yī)藥國際交流和展示窗口。2021年醫(yī)院成為國家區(qū)域醫(yī)療中心建設輸出醫(yī)院，目前北京中醫(yī)藥大學東直門醫(yī)院廈門醫(yī)院、北京中醫(yī)藥大學東直門醫(yī)院洛陽醫(yī)院成為第三批國家區(qū)域醫(yī)療中心建設單位，至此醫(yī)院總規(guī)劃編制床位超過6000張，成為我國中醫(yī)藥領域“國之重器”，將為成就“國之大者”輝煌業(yè)績發(fā)揮更加積極的作用。
雄關漫道真如鐵，而今邁步從頭越。面向未來，醫(yī)院將進一步弘揚“求是善行”的院訓精神，把握機遇，乘勢而上，踔厲奮發(fā)，勇毅前行，全面推進高質量內涵式發(fā)展，努力建設成為國內首善國際一流中醫(yī)醫(yī)院，為健康中國和人類衛(wèi)生健康共同體貢獻智慧和力量。