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北京市疾病預(yù)防控制中心（北京市預(yù)防醫(yī)學(xué)科學(xué)院、北京結(jié)核病控制研究與防治所）是北京市衛(wèi)生健康委員會直屬正處級公益一類事業(yè)單位。
中心前身為1953年10月成立的北京市衛(wèi)生防疫站。2000年6月，根據(jù)國務(wù)院關(guān)于衛(wèi)生監(jiān)督、衛(wèi)生防病體制改革的總體要求，由原北京市衛(wèi)生防疫站、北京市勞動衛(wèi)生與職業(yè)病研究所、北京市健康教育所、北京市性病防治所合并組建北京市疾病預(yù)防控制中心，并成立北京市預(yù)防醫(yī)學(xué)研究中心；2021年5月，根據(jù)《中共北京市委機(jī)構(gòu)編制委員會關(guān)于市衛(wèi)生健康委和市中醫(yī)局所屬事業(yè)單位改革有關(guān)事項(xiàng)的批復(fù)》（京編委〔2021〕120號），在原北京市疾病預(yù)防控制中心、北京市預(yù)防醫(yī)學(xué)研究中心、北京市結(jié)核病控制研究所基礎(chǔ)上，重新組建北京市疾病預(yù)防控制中心（北京市預(yù)防醫(yī)學(xué)科學(xué)院、北京結(jié)核病控制研究與防治所）。
中心承擔(dān)著北京市傳染性疾病、慢性非傳染性疾病、學(xué)生常見病、病媒生物傳播疾病等預(yù)防與控制，開展疾病監(jiān)測與預(yù)警和疾病流行規(guī)律研究；承擔(dān)全市傳染病疫情溯源和調(diào)查處置，突發(fā)公共衛(wèi)生事件和災(zāi)害疫情應(yīng)急處置；開展健康危害因素監(jiān)測與干預(yù)工作，開展食源性、職業(yè)性、放射性、環(huán)境性等疾病的監(jiān)測評價(jià)和流行病學(xué)調(diào)查，開展公眾健康和營養(yǎng)狀況監(jiān)測與評價(jià)，提出干預(yù)策略和措施；承擔(dān)全市結(jié)核病預(yù)防與控制；同時(shí)還肩負(fù)著首都重大政治、經(jīng)濟(jì)、社會活動的公共衛(wèi)生保障、首都生物反恐怖襲擊應(yīng)急等任務(wù)；開展公共衛(wèi)生與疾病預(yù)防控制的基礎(chǔ)性和應(yīng)用性科學(xué)研究與科技創(chuàng)新，促進(jìn)科研成果轉(zhuǎn)化。
中心內(nèi)設(shè)中心辦、黨辦、紀(jì)檢辦等16個(gè)職能科所和傳染病地方病控制所、免疫預(yù)防所、性病艾滋病防治所等18個(gè)業(yè)務(wù)科所。截至2023年8月，批準(zhǔn)編制1023人，在編職工765人，占編率74.7％；在編衛(wèi)生技術(shù)人員635人，占83.0％，中級及以上職稱占比70.7％（其中高級職稱占33.4％），碩士及以上學(xué)歷占54.2％（其中博士學(xué)歷占12.9％）。
截至2023年8月，現(xiàn)有國家級和省部級高層次人才37人次，北京市首席公共衛(wèi)生專家4名，首都高層次公共衛(wèi)生技術(shù)領(lǐng)軍人才5名，學(xué)科帶頭人7名，學(xué)科骨干18名。近五年獲批各級各類科研項(xiàng)目經(jīng)費(fèi)2.93億元；承擔(dān)省部級以上項(xiàng)目172項(xiàng)；作為主持單位獲北京市科委科學(xué)技術(shù)獎(jiǎng)3項(xiàng)，中華預(yù)防醫(yī)學(xué)會科學(xué)技術(shù)獎(jiǎng)二等獎(jiǎng)2項(xiàng)、三等獎(jiǎng)3項(xiàng)；獲批專利授權(quán)35項(xiàng)，其中：首次取得國際專利授權(quán)1項(xiàng)，國家發(fā)明專利24項(xiàng)，實(shí)用新型專利技術(shù)10項(xiàng)；以第一單位發(fā)表科技論文865篇，其中SCI/SSCI論文137篇。截至2022年底，作為第一起草單位制修訂國家標(biāo)準(zhǔn)29項(xiàng)，行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)10項(xiàng)，地方標(biāo)準(zhǔn)28項(xiàng)，團(tuán)體標(biāo)準(zhǔn)16項(xiàng)，在研項(xiàng)目21項(xiàng)；發(fā)布新冠疫情防控相關(guān)地方標(biāo)準(zhǔn)8項(xiàng)。近五年累計(jì)培養(yǎng)帶教本科生、研究生454人。
中心現(xiàn)址四個(gè)院區(qū)，總占地面積25104.76平方米，建筑面積51380平方米。新址位于通州區(qū)宋莊鎮(zhèn)雙埠頭工業(yè)園區(qū)，建設(shè)用地80400平方米，建設(shè)總規(guī)模124500平方米，計(jì)劃2025年7月完工。中心擁有大型設(shè)備780余臺（件），具備開展生物、化學(xué)、聲學(xué)、熱學(xué)、光學(xué)和輻射等多個(gè)領(lǐng)域的33類1122項(xiàng)檢測能力。擁有流感、麻疹、脊灰3個(gè)國家級網(wǎng)絡(luò)實(shí)驗(yàn)室，以及食品非法添加物、獸藥殘留和有害元素3個(gè)國家參比實(shí)驗(yàn)室；北京市食物中毒診斷溯源技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室；是全國健康促進(jìn)與教育示范基地、北京市醫(yī)防融合培訓(xùn)基地、國家公共衛(wèi)生醫(yī)師資格實(shí)踐技能考試與考官培訓(xùn)基地等全國多項(xiàng)培訓(xùn)、科研教學(xué)基地、委員會承擔(dān)單位；國家衛(wèi)生有害生物防制標(biāo)準(zhǔn)專業(yè)委員會、北京市公共衛(wèi)生標(biāo)準(zhǔn)化技術(shù)委員會、北京市食品安全地方標(biāo)準(zhǔn)評審委員會3個(gè)秘書處設(shè)在我中心。