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南方醫(yī)科大學口腔醫(yī)院，即原來的廣東省口腔醫(yī)院，始建于1962年，是廣東省最早建立的口腔醫(yī)院，也是我國最早建立的五大臨床口腔醫(yī)院之一。2017年1月1日起按照廣東省政府要求成建制劃轉(zhuǎn)南方醫(yī)科大學管理，名為南方醫(yī)科大學口腔醫(yī)院（廣東省口腔醫(yī)院、廣東省牙病防治指導中心、廣東省口腔醫(yī)學研究院）。南方醫(yī)科大學口腔醫(yī)院（廣東省口腔醫(yī)院）是華南地區(qū)建院歷史悠久、總體規(guī)模領(lǐng)先、技術(shù)力量雄厚，集醫(yī)療、教學、科研、預(yù)防為一體的區(qū)域性最具規(guī)模的大型口腔醫(yī)院。
醫(yī)院規(guī)模逐步擴大，現(xiàn)有六個院區(qū)，分別為總院區(qū)（院本部）、番禺院區(qū)、海珠廣場院區(qū)、盤福院區(qū)、順德分院、從化分院；一個下屬單位廣東粵誠牙科技術(shù)開發(fā)中心。醫(yī)院主辦中國科技核心期刊《口腔疾病防治》。
醫(yī)院內(nèi)設(shè)33個業(yè)務(wù)科室、10個管理科室、8個醫(yī)技科室。在職教職員工1165人，其中高級職稱的專業(yè)技術(shù)人員167人，研究生導師33人，博士109人，碩士221人，留學歸國人員21人。現(xiàn)有牙科綜合治療臺459張，開放床位數(shù)93張。
醫(yī)院作為�？瓶谇会t(yī)療機構(gòu)，一直致力于服務(wù)質(zhì)量和水平的提高，取得了顯著成效。2019年11月榮登“全國醫(yī)院互聯(lián)網(wǎng)影響力排行榜”口腔科第九名，是華南地區(qū)唯一上榜的口腔醫(yī)院。該榜單由中國社會科學院健康業(yè)發(fā)展研究中心等權(quán)威機構(gòu)發(fā)布，共涉及29個�？�，研究數(shù)據(jù)覆蓋全國9852家公立醫(yī)院，509.4億次患者瀏覽軌跡，5700萬名患者在線問診記錄，3.1億次醫(yī)患交流，429.8萬條患者在醫(yī)院就診后的線上評價，是口腔醫(yī)院服務(wù)質(zhì)量和水平的綜合體現(xiàn)。醫(yī)院立足華南、影響力輻射港澳臺地區(qū)及海外，2005年被評為“香港市民最信任的內(nèi)地醫(yī)療機構(gòu)”。
醫(yī)院擁有國內(nèi)一流的口腔種植中心，年接診的種植患者數(shù)量近2萬，數(shù)字化種植修復技術(shù)位居國內(nèi)領(lǐng)先水平；牙周病科以全國第二名的成績摘取“國家臨床重點�？啤保�成為第一批國家臨床重點�？�；口腔正畸正頜治療中心綜合規(guī)模、技術(shù)力量處華南地區(qū)領(lǐng)先水平；醫(yī)院開展隱形矯治、兒童口腔舒適化治療、顯微根管治療、計算機設(shè)計與輔助的牙體修復、微創(chuàng)拔牙、特殊牙合型總義齒及數(shù)字化全口義齒等新診療技術(shù)項目；擁有先進的數(shù)字化義齒加工設(shè)備；醫(yī)院在國內(nèi)最早全面開展“牙科四手操作”服務(wù)，率先實現(xiàn)“一人一機一滅菌”。
2017年獲批廣東省口腔醫(yī)學研究院，擁有實驗室面積2500平方米。近三年獲得省部級科技進步二等獎1項、授權(quán)專利4件，承擔國家級科研項目12項，縱向課題資助總額達765.6萬元。發(fā)表SCI數(shù)據(jù)庫收錄的論文75篇，總IF值172.551。教學方面：近三年舉辦國家級、省級繼教項目30項，住院醫(yī)師規(guī)范化培訓及各級教學工作有序開展，共培養(yǎng)各級各類人才208人次。
醫(yī)院作為廣東省牙病防治指導中心，承擔指導全省口腔疾病防治規(guī)劃、實施、培訓指導和管理總結(jié)等任務(wù)。2019年被中國牙防基金會評為“整合資源，健康口腔——多模式口腔疾病防治”最佳管理單位，并被確定為“健康口腔指導中心”。
醫(yī)院牽頭成立南方醫(yī)科大學口腔醫(yī)院（廣東省口腔醫(yī)院）專科聯(lián)盟，是廣東省首個口腔專科聯(lián)盟，覆蓋全省，不定期向基層單位派駐醫(yī)療骨干，開展遠程會診及專業(yè)培訓等。從1995年開始連續(xù)成功舉辦了24屆華南國際口腔技術(shù)研討會，從2007年起連續(xù)成功舉辦13屆粵港澳臺口腔種植論壇，從2011年起承辦了5期東盟國家口腔醫(yī)療技術(shù)培訓班，此培訓班為國家科技部發(fā)展中國家技術(shù)培訓班項目之一。醫(yī)院是國家級住院醫(yī)師規(guī)范化培訓基地、是廣東省最先確立的國家醫(yī)師資格考試實踐技能考試與考官培訓基地、是中華口腔醫(yī)學會及北京大學醫(yī)學網(wǎng)絡(luò)教育學院口腔專業(yè)護士臨床實踐培訓基地及廣東省口腔�？谱o士培訓基地。
屬企業(yè)廣東粵誠牙科技術(shù)開發(fā)中心，為國家高新技術(shù)企業(yè)，是一家大型國有義齒加工制作中心，在行業(yè)內(nèi)通過了IS09001質(zhì)量認證，承接國內(nèi)外義齒制作和加工。
醫(yī)院主辦的口腔醫(yī)學學術(shù)類雜志---《口腔疾病防治》，1993年創(chuàng)刊，原名《牙病防治雜志》，1995更名為《廣東牙病防治》，2016年變更為現(xiàn)用名。為中國科技核心期刊，被美國Ulrichsweb、瑞典DOAJ、WHO西太平洋地區(qū)醫(yī)學索引（WPRIM）、波蘭《哥白尼索引》等多家國際重要數(shù)據(jù)庫收錄。